受到武漢肺炎疫情擴大的影響，全球科技產業供應鏈受到衝擊，導致以出口導向為主的台灣經濟，亦在本次疫情中受到影響，因此，台灣政府於週三 (12 日) 調降對於 2020 年 GDP 增長的預估值，由 2.72% 調降至 2.37%，外資分析師對此認為，武漢疫情造成供應鏈受到阻斷，台灣將可能受到重創。
ING 集團經濟學家 Iris Peng 表示，由於武漢疫情造成供應鏈受到阻斷，而台灣又在全球供應鏈中扮演著重要的角色，因此，預期台灣的經濟將受到重創，並將 2020 年的 GDP 增長預估值，由 1.6% 調降至 0.8%。
除此之外，亦有其他分析師對於台灣的經濟前景，抱持著更為悲觀的態度。受到中國延後復工的影響，使得將生產基地設於中國的台灣廠商，亦面臨著生產線中斷的危機。
根據台灣行政院主計總處於去年 11 月所公佈數據，預估 2020 年的經濟成長率及出口增長率，將分別為 2.72% 及 3.12%，然而隨著武漢疫情的爆發，重創了台灣的出口及國內消費需求，導致主計總處於週三 (12 日)，將 GDP 及出口增長預估值，分別調降至 2.37% 及 2.85%。
另外，根據主計總處於週三 (12 日) 公佈的數據，2019 年第四季的 GDP 增長率，由原本的 3.38% 下修至 3.31%，而全年 GDP 增長率則是由 2.73% 下修至 2.71%。受惠於電子業需求回溫、以及中美貿易緊張關係疏緩，台灣於去年第四季的經濟成長幅度，創下近 1 年半以來最高。
由於台灣是亞洲地區科技產品的主要出口大國，預期第一季的出口額將會受到武漢疫情的影響。另外，政府亦調降 2020 年的預估通膨增長率，由 0.71% 調降至 0.62%。
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