南韓的中央防疫對策本部在週五 (6 日) 傍晚 5 點過後，公布了該國最新的武漢肺炎疫情狀況，從 6 日凌晨 0 點到同日下午 4 點的 16 個小時內，確診病例又新增 309 人，累計確診人數達到 6593 人。而累計的死者人數則維持在同 (6) 日上午所公布的 43 人。
日本政府在週四 (5 日) 決定，取消先前對中、韓兩國旅客所發出的簽證效力，也禁止免簽入境。中、韓兩國飛往日本的班機，也只能利用東京成田機場與大阪關西機場，從這兩國入境日本的旅客們 (包含日本人) 在檢疫所的判斷下，也可要求在指定地點隔離 2 週，還有曾經在南韓及伊朗部分地區停留的旅客，也都禁止入境日本。
受到日本上述決定影響，南韓外長康京和也在 6 日下午召見日本駐韓大使冨田浩司，向日方傳達嚴正抗議。而由外長本人親自召見駐韓使節，也實屬罕見。
南韓國務總理丁世均也在 6 日上午的政府會議上表示，該國將採取恰當的因應措施。南韓外交部也暗示，打算針對日本提高旅遊警示等其他處置。而青瓦台的政策室長金尚組也在 5 日晚間的 KBS 新聞節目上表示，對日本當局的決定感到失望與遺憾。
