透過AI研發新藥 在Nature子期刊發表成果

透過AI研發新藥 在Nature子期刊發表成果(圖:shutterstock)
透過AI研發新藥 在Nature子期刊發表成果(圖:shutterstock)

近日發表於 Nature Biotechnology 的研究,首次闡述全球首款人工智慧(AI)藥物 INS018_055 的研發歷程,涵蓋從 AI 演算法開發到 2 期臨床試驗的全流程。

研究全面闡述了其首款由生成式 AI 發現和設計的潛在「全球首創」(first-in-class)TNIK 抑制劑從人工智慧演算法開發到 2 期臨床試驗的研發歷程,並首次披露了該候選藥物,在臨床前實驗和臨床試驗的數據和表現。 

研究團隊的在 Nature 子期刊上發表了最新的研究成果。據其表示,該研究突顯了 AI 驅動的藥物發現方法所帶來的降本增效優勢,並強調了生成式 AI 技術在推動產業變革方面的巨大潛力。

美國生物科技公司英矽智能 (Insilico Medicine) 創辦人兼執行長 Alex Zhavoronkov 表示,「從這篇論文中,我們看到生成式 AI 簡化早期藥物發現的潛力,該解決方案的擴展應用有望解決行業面臨的成本和效率挑戰,高效提供創新療法 盡快惠及全球病患。」

據報導,作為新藥研發的第一步,英矽智能選擇以與衰老密切相關的纖維化作為研究重心,採用組織纖維化相關的組學和臨床數據集,對 Pharma.AI 平台下屬的靶點發現引擎 PandaOmics 進行 訓練。 以此為基礎,PandaOmics 平台透過深度特徵合成、因果關係推斷和全新通路重建等過程提名潛在標靶清單。

此後,PandaOmics 中的自然語言處理(NLP)模型透過分析了涵蓋專利、出版物、研發基金、臨床試驗等文本數據的數百萬個文本文件,進一步評估潛在靶點的新穎性以及與疾病的關聯 性,最終確定 TNIK 為最有潛力的抗纖維化標靶。 值得注意的是,歷史研究曾揭示 TNIK 與多種纖維化驅動生物路徑的間接關聯,但從未提出將其作為特發性肺纖維化(IPF)治療標靶。

在確定 TNIK 標靶後,英矽智慧研發團隊利用 Pharma.AI 下屬的生成化學引擎 Chemistry42,根據基於結構的藥物設計(SBDD)策略產生具有所需特性的創新分子結構,旨在得到安全、特異性、 高效的 TNIK 抑制劑。

Chemistry42 結合了 40 多種生成化學演算法和超過 500 個預訓練的獎勵模型,支援新穎化合物從頭生成,能根據專家回饋進行虛擬篩選並優化生成結果。 經過多次迭代篩選,團隊發現了 IC50 值達到納摩爾級別的潛力苗頭化合物,並在針對溶解度、ADME 安全性、毒性進行優化的同時保留其對 TNIK 的顯著親和力,最終獲得了候選分子 INS018_055,共 合成並測試了不到 80 個分子。

英矽智能在新一代大語言模型 ChatGPT-4 Turbo 和自有大語言模型(LLM)基礎上開發了 PaperGPT 論文解讀引擎,透過語言對話功能提供與論文相關問題的專業解答。

關於本計畫的原始實驗數據,可透過存取英矽智能的數據中心獲取,包括 13 項臨床前實驗和 3 項臨床試驗的部分數據。


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