日本政府在週三 (13 日) 決定強化境管規定，最快從明 (14) 日起將拒絕所有外國人入境日本。原本可以入境日本的台灣商務人士，也將受到影響。
目前日本以特例方式，接受來自台灣、中國、韓國等 11 個國家地區的商務人士入境日本，但為了配合日本當地的緊急狀態實施範圍擴大，最快從 14 日 (週四) 起就會拒絕所有的外國人入境，只有特殊理由才會受理。
關於 11 個國家地區商務人士入境日本的問題，先前日本首相菅義偉就曾經表示若是日本當地發現傳染能力更強的新冠病毒 (COVID-19) 變種病毒株，就會「立刻中斷」該項入境措施。不過日本在野黨則是憂心境外移入的案例發生，就曾倡議不論日本境內是否發現變種病毒，都應該立即封鎖日本國門拒絕外國人入境。
在 2020 年 12 月的時候，日本當局決定到 2021 年 1 月底前拒絕外國人入境日本，但是特例開放台灣、中國、韓國等共 11 個國家地區的商務往來。
另外從元月 8 日起，日本當局也決定在緊急狀態的發布期間，包含日本人在內所有入境日本的旅客都需提交出國前 72 小時內的新冠病毒檢查陰性證明書。
